Keroro je vanzemaljac nalik žabi poslat sa svoje planete na misiju osvajanja Zemlje. Ali kada mu se otkrije identitet, njegov bataljon ga napušta i on završava u domu porodice Hinata. Tamo je primoran obavljati kućne poslove i spavati u mračnom podrumu opsednutom duhom koji je nekada navodno bio zatvorska ćelija nevine devojčice. Čak provodi svoje slobodno vreme sastavljajući modele maketa. Tokom svog boravka, Keroro sreće svoje članove jedinice koji su takođe ostali nasukani tokom neuspele invazije.